Featured NASA ประกาศนำ Supercomputer ของตัวเองเข้าสู่สงครามกับ COVID-19
NASA ประกาศนำ Supercomputer ของตัวเองเข้าสู่สงครามกับ COVID-19

Chottiwatt Jittprasong

NASA ประกาศนำ Supercomputer ของตัวเองเข้าสู่สงครามกับ COVID-19

March 27, 2020

สถานการณ์ COVID-19 ได้ดำเนินมาถึงจุดที่ทุก Industry ต้องช่วยพึงกันและกันแล้ว ไม่ใช่แค่ทางด้านการแพทย์ แต่เป็นทั้งด้านเทคโนยี ด้านการสื่อสารทางวิทยาศาสตร์ เรา Spaceth.co ก็ขอเป็นส่วนหนึ่งในการหยุดยั้งการระบาดของ COVID-19 เช่นกัน

เมื่อวันที่ 23 มีนาคม 2020 White House ประกาศ launch COVID-19 High Performance Computing Consortium เปิดสงครามระหว่าง Supercomputer กับ COVID-19 อย่างเป็นทางการ เปิดโอกาสให้นักวิจัยทั่วโลกได้ใช้ High-performance grid computing ที่มีกำลังคำนวณสูงที่สุดในโลก

อเมริกากำลังต่อสู้กับ COVID-19 นั้นหมายถึงการปล่อย Supercomputer grid ของเราให้นักวิจัยได้ใช้เพื่อเร่งการวิจัยด้านวิทยาศาสตร์ ด้านการรักษาและด้านการพัฒนาวัคซีน

Michael Katsios, US. Chief Technology Officer

หน่วยงานที่ร่วมด้วยช่วยกันแบ่งทรัพยาการ Supercomputer ให้กับการวจัย COVID มีตั้งแต่ระดับ Industry, Academic จนถึง Federal agency เลยทีเดียว

  • Industry
    • IBM
    • Amazon Web Services
    • Google Cloud
    • Microsoft
    • Hewlett Packard Enterprise
  • Academic
    • Massachusetts Institute of Technology (MIT)
    • Rensselaer Polytechnic Institute
  • U.S. Dept. of Energy National Laboratories
    • Argonne National Laboratory
    • Lawrence Livermore National Laboratory
    • Los Alamos National Laboratory
    • Oak Ridge National Laboratory
    • Sandia National Laboratory
  • Federal Agencies
    • National Science Foundation
    • National Aeronautics and Space Administration (NASA)

Jim Bridenstine ผอ. ของ NASA ทวีตว่าเขายินดีเป็นอย่างมากที่จะให้ Supercomputer ของ NASA ร่วมรบกับ COVID-19

COVID-19 HPC Consortium

COVID-19 High-performance computing Consortium บน Platform XSEDE (Extreme Science and Engineering Discovery Environment) เป็น Grid computing platform ที่รวบรวมกำลังสำคัญในการทำวิจัยอย่าง Supercomputer หลายเครื่องทั่วโลกเอาไว้

XSEDE Grid Computing Platform – ที่มา XSEDE

หลาย ๆ หน่วยงานแบ่งทรัพยาการ Supercomputer เข้าไปไว้ใน XSEDE เพื่อให้นักวิจัยได้ใช้ในการคำนวณการคาดการณ์ต่าง ๆ รวมถึงการจำลองโมเดลการติดเชื้อของ COVID-19 เพื่อหาวิธีการผลิตวัคซีน

อย่างหน่วยงาน U.S. DOE National Nuclear Security Administration ที่มีแล็บคอมพิวเตอร์หลายแล็บอย่าง Los Alamos National Laboratory (LLNL), Sandia NL (SNL), Lawlence Livermore NL (LLNL) ก็ได้ส่ง HPC resource ให้กับ COVID-19 HPC Conso)rtium ดังนี้

  • LLNL Lassen
    • 23 petaFLOPS, 788 compute nodes
    • 28 TF per node
    • 253,440 GB Total memory
  • LLNL Quartz
    • 3.2 petaFLOPS, 3004 compute nodes
    • 1.2 TF per node
    • 344,064 GB Total memory
  • LLNL Pascal
    • 0.9 petaFLOPS, 153 compute nodes
    • 11.6 TF per node
    • 41,984 GB Total memory
LLNL Lassen Supercomputer – ที่มา LLNL

Supercomputer ของ U.S. National Science Foundation (NSF) ที่ส่งให้ COVID-19 HPC Consortium มีดังนี้

  • Frontera
  • Comet
  • Stampede 2
  • Bridges and Bridges-AI
  • Jetstream
Comet Supercupter – ที่มา SDSC

ส่วน NASA ก็มี High-End Computing Capability (HECC) ที่เป็นหนึ่งใน Grid computing ที่ใหญ่ที่สุดในโลกเช่นกัน ซึ่งดูแลโดย NASA Advanced Supercomputing Division ที่ตั้งอยู่ที่ NASA Ames Research Center ในรัฐ California (ที่กำลังชิบหายจาก COVID-19)

ใน HECC ของ NASA ก็จะมี Supercomputer ระดับ Petascale อย่าง Aitken, Electra และ Pleiades ในตำนาน

การรวมตัวกันของ Supercomputer ทั่วโลกครังนี้ถือเป็นการสร้าง Grid computing ที่เรียกได้ว่าใหญ่ที่สุดในโลกเพื่อช่วยนักวิจัยทั่วโลกในการวิจัยสู้กับ COVID-19

Grid computing เป็นการเชื่อมโยงคอมพิวเตอร์หลาย ๆ เครื่องเข้าด้วยกันคล้าย ๆ กับการทำ Clustering อย่างของโครงการ [email protected] ที่กำลังจะหยุดส่งข้อมูลในวันที่ 31 มีนาคม 2020 ซึ่งเป็นการสร้าง Grid computing ระดับ user ที่ปล่อยให้ผู้ใช้อย่างเราสามารถนำ CPU มาช่วยประมวลผลข้อมูลได้

แล้ว Supercomputer จะช่วยอะไรเรา

High-performance grid computing systems จะช่วยให้นักวิจัยคำนวณ model ทางคณิตศาสตร์ได้หลาย ๆ อย่าง เช่น ทางด้านระบาดวิทยา ชีวสารสนเทศ แบบจำลองระดับโมเลกุล การคำนวณเหล่านี้ถ้าใช้คอมพิวเตอร์ธรรมดาต้องทำเป็นเดือนถึงเป็นปี

ด้วยการร่วมมือกันของหน่วยงานหลายหน่วยงานอย่าง IBM, LLNL, ANL, ORNL. SNL, LANL, NSF, NASA, MIT, RPI, etc. สร้าง Grid computing ที่ใหญ่ที่สุดในโลกขึ้นมาให้นักวิทยาศาสตร์นักวิจัยได้ใช้ในการร่วมวิจัยวัคซีน COVID-19

การจำลอง Molecular Model – ที่มา Singularity Hub

อย่างเช่น Supercomputer ของ IBM อย่าง Summit หนึ่งใน Supercomputer ที่มีกำลังคำนวณสูงที่สุดในโลกก็ได้เปิดให้นักวิจัยที่ ORNL และ University of Tennessee ได้ใช้ในการสแกนสารประกอบกว่า 8,000 สารที่สามารถ bind กับ protein บน envelop ของ coronavirus ได้ เพื่อ inhibit การ bind กับเซลล์ในร่างกาย ซึ่งหากไม่มี Supercomputer สิ่งเหล่านี้จะไม่เกิดขึ้นเลย

IBM Summit Supercomputer ที่เร็วที่สุดในโลก – ที่มา IBM

เจ้า IBM Summit มีกำลังคำนวณประมาณ 200 petaFLOPS ซึ่งเร็วกว่า Pleiades ของ NASA กว่า 40 เท่า (Pleiades มีกำลังประมาณ 5.95 petaFLOPS) ทำให้ COVID-19 HPC Consortium เป็น Grid computing ที่เร็วที่สุดในโลก ตอนนี้ COVID-19 HPC Consortium ก็ได้เจอ 77 สารประกอบที่สามารถหยุด Coronavirus ได้แล้วและกำลังอยู่ในระหว่างการทดสอบทางการแพทย์ต่อไป

สุดท้ายนี้ก็หวังว่าทุก Industry จะร่วมด้วยช่วยกันหยุดยั้งการแพร่ระบาดของ COVID-19 ส่งกำลังใจให้นักวิจัยนักวิทยาศาสตร์บุคลากรทางการแพทย์ที่กำลังต่อสู้กับ COVID-19 เรา Spaceth.co ขอเป็นหนึ่งในกำลังที่จะช่วยผลักดันการสื่อสารวิทยาศาสตร์

COVID-19 must be defeated.

Spaceth.co Editorial Staff

เรียบเรียงโดย ทีมงาน SPACETH.CO

อ้างอิง

IBM and Coronavirus

White House Statement

COVID-19 HPC Consortium

XSEDE Platform





Read More

บทความอื่น ๆ ที่ควรอ่านต่อ



เรื่องราวน่าสนใจ

อัพเดทเรื่องราว ข่าว และบทวิเคราะห์เจาะลึก