สถานการณ์ COVID-19 ได้ดำเนินมาถึงจุดที่ทุก Industry ต้องช่วยพึงกันและกันแล้ว ไม่ใช่แค่ทางด้านการแพทย์ แต่เป็นทั้งด้านเทคโนยี ด้านการสื่อสารทางวิทยาศาสตร์ เรา Spaceth.co ก็ขอเป็นส่วนหนึ่งในการหยุดยั้งการระบาดของ COVID-19 เช่นกัน
เมื่อวันที่ 23 มีนาคม 2020 White House ประกาศ launch COVID-19 High Performance Computing Consortium เปิดสงครามระหว่าง Supercomputer กับ COVID-19 อย่างเป็นทางการ เปิดโอกาสให้นักวิจัยทั่วโลกได้ใช้ High-performance grid computing ที่มีกำลังคำนวณสูงที่สุดในโลก
อเมริกากำลังต่อสู้กับ COVID-19 นั้นหมายถึงการปล่อย Supercomputer grid ของเราให้นักวิจัยได้ใช้เพื่อเร่งการวิจัยด้านวิทยาศาสตร์ ด้านการรักษาและด้านการพัฒนาวัคซีน
Michael Katsios, US. Chief Technology Officer
หน่วยงานที่ร่วมด้วยช่วยกันแบ่งทรัพยาการ Supercomputer ให้กับการวจัย COVID มีตั้งแต่ระดับ Industry, Academic จนถึง Federal agency เลยทีเดียว
- Industry
- IBM
- Amazon Web Services
- Google Cloud
- Microsoft
- Hewlett Packard Enterprise
- Academic
- Massachusetts Institute of Technology (MIT)
- Rensselaer Polytechnic Institute
- U.S. Dept. of Energy National Laboratories
- Argonne National Laboratory
- Lawrence Livermore National Laboratory
- Los Alamos National Laboratory
- Oak Ridge National Laboratory
- Sandia National Laboratory
- Federal Agencies
- National Science Foundation
- National Aeronautics and Space Administration (NASA)
Jim Bridenstine ผอ. ของ NASA ทวีตว่าเขายินดีเป็นอย่างมากที่จะให้ Supercomputer ของ NASA ร่วมรบกับ COVID-19
COVID-19 HPC Consortium
COVID-19 High-performance computing Consortium บน Platform XSEDE (Extreme Science and Engineering Discovery Environment) เป็น Grid computing platform ที่รวบรวมกำลังสำคัญในการทำวิจัยอย่าง Supercomputer หลายเครื่องทั่วโลกเอาไว้
หลาย ๆ หน่วยงานแบ่งทรัพยาการ Supercomputer เข้าไปไว้ใน XSEDE เพื่อให้นักวิจัยได้ใช้ในการคำนวณการคาดการณ์ต่าง ๆ รวมถึงการจำลองโมเดลการติดเชื้อของ COVID-19 เพื่อหาวิธีการผลิตวัคซีน
อย่างหน่วยงาน U.S. DOE National Nuclear Security Administration ที่มีแล็บคอมพิวเตอร์หลายแล็บอย่าง Los Alamos National Laboratory (LLNL), Sandia NL (SNL), Lawlence Livermore NL (LLNL) ก็ได้ส่ง HPC resource ให้กับ COVID-19 HPC Conso)rtium ดังนี้
- LLNL Lassen
- 23 petaFLOPS, 788 compute nodes
- 28 TF per node
- 253,440 GB Total memory
- LLNL Quartz
- 3.2 petaFLOPS, 3004 compute nodes
- 1.2 TF per node
- 344,064 GB Total memory
- LLNL Pascal
- 0.9 petaFLOPS, 153 compute nodes
- 11.6 TF per node
- 41,984 GB Total memory
Supercomputer ของ U.S. National Science Foundation (NSF) ที่ส่งให้ COVID-19 HPC Consortium มีดังนี้
- Frontera
- Comet
- Stampede 2
- Bridges and Bridges-AI
- Jetstream
ส่วน NASA ก็มี High-End Computing Capability (HECC) ที่เป็นหนึ่งใน Grid computing ที่ใหญ่ที่สุดในโลกเช่นกัน ซึ่งดูแลโดย NASA Advanced Supercomputing Division ที่ตั้งอยู่ที่ NASA Ames Research Center ในรัฐ California (ที่กำลังชิบหายจาก COVID-19)
ใน HECC ของ NASA ก็จะมี Supercomputer ระดับ Petascale อย่าง Aitken, Electra และ Pleiades ในตำนาน
การรวมตัวกันของ Supercomputer ทั่วโลกครังนี้ถือเป็นการสร้าง Grid computing ที่เรียกได้ว่าใหญ่ที่สุดในโลกเพื่อช่วยนักวิจัยทั่วโลกในการวิจัยสู้กับ COVID-19
Grid computing เป็นการเชื่อมโยงคอมพิวเตอร์หลาย ๆ เครื่องเข้าด้วยกันคล้าย ๆ กับการทำ Clustering อย่างของโครงการ SETI@home ที่กำลังจะหยุดส่งข้อมูลในวันที่ 31 มีนาคม 2020 ซึ่งเป็นการสร้าง Grid computing ระดับ user ที่ปล่อยให้ผู้ใช้อย่างเราสามารถนำ CPU มาช่วยประมวลผลข้อมูลได้
แล้ว Supercomputer จะช่วยอะไรเรา
High-performance grid computing systems จะช่วยให้นักวิจัยคำนวณ model ทางคณิตศาสตร์ได้หลาย ๆ อย่าง เช่น ทางด้านระบาดวิทยา ชีวสารสนเทศ แบบจำลองระดับโมเลกุล การคำนวณเหล่านี้ถ้าใช้คอมพิวเตอร์ธรรมดาต้องทำเป็นเดือนถึงเป็นปี
ด้วยการร่วมมือกันของหน่วยงานหลายหน่วยงานอย่าง IBM, LLNL, ANL, ORNL. SNL, LANL, NSF, NASA, MIT, RPI, etc. สร้าง Grid computing ที่ใหญ่ที่สุดในโลกขึ้นมาให้นักวิทยาศาสตร์นักวิจัยได้ใช้ในการร่วมวิจัยวัคซีน COVID-19
อย่างเช่น Supercomputer ของ IBM อย่าง Summit หนึ่งใน Supercomputer ที่มีกำลังคำนวณสูงที่สุดในโลกก็ได้เปิดให้นักวิจัยที่ ORNL และ University of Tennessee ได้ใช้ในการสแกนสารประกอบกว่า 8,000 สารที่สามารถ bind กับ protein บน envelop ของ coronavirus ได้ เพื่อ inhibit การ bind กับเซลล์ในร่างกาย ซึ่งหากไม่มี Supercomputer สิ่งเหล่านี้จะไม่เกิดขึ้นเลย
เจ้า IBM Summit มีกำลังคำนวณประมาณ 200 petaFLOPS ซึ่งเร็วกว่า Pleiades ของ NASA กว่า 40 เท่า (Pleiades มีกำลังประมาณ 5.95 petaFLOPS) ทำให้ COVID-19 HPC Consortium เป็น Grid computing ที่เร็วที่สุดในโลก ตอนนี้ COVID-19 HPC Consortium ก็ได้เจอ 77 สารประกอบที่สามารถหยุด Coronavirus ได้แล้วและกำลังอยู่ในระหว่างการทดสอบทางการแพทย์ต่อไป
สุดท้ายนี้ก็หวังว่าทุก Industry จะร่วมด้วยช่วยกันหยุดยั้งการแพร่ระบาดของ COVID-19 ส่งกำลังใจให้นักวิจัยนักวิทยาศาสตร์บุคลากรทางการแพทย์ที่กำลังต่อสู้กับ COVID-19 เรา Spaceth.co ขอเป็นหนึ่งในกำลังที่จะช่วยผลักดันการสื่อสารวิทยาศาสตร์
COVID-19 must be defeated.
Spaceth.co Editorial Staff
เรียบเรียงโดย ทีมงาน SPACETH.CO
อ้างอิง
